Palīdzība vēlējās: jauns projekts jūsu mājas datoram, lai palīdzētu pārvarēt HIV, Alcheimera slimību un citus apstākļus - Veselība - 2020

Saturs:

Anonim

Cilvēka smadzenes gūst labumu no pārtraukumiem, bet dators var doties spēcīgs visu dienu. Tātad, kāpēc ne piesaistīt savu varu vismodernākajos pētījumos, kamēr tu esi prom no atjaunošanas uz kafiju vai pusdienām?

Jauna programma ir datoru dīkstāves laiks, lai cīnītos pret tādām slimībām kā HIV infekcija un Alcheimera slimība. Docking @ Home, ko izstrādājusi Delavēras Universitātes komanda, finansē Nacionālais zinātnes fonds, pievienojas arvien vairākiem projektiem - no kosmosa ārvalstnieku uzklausīšanas līdz klimata pārmaiņu modelēšanai -, kas tiek izmantoti atklātā pirmkoda sistēmā BOINC ( Berkeley atvērta tīkla skaitļošanas infrastruktūra).

„Pat bez lieliem superdatoru resursiem mēs varam veikt nozīmīgus pētījumus ar brīvprātīgo starpniecību internetā,” saka Mārela Taufera, Delavēras Universitātes datoru un informācijas zinātņu docente. Viņa vada projektu, kura mērķis ir palielināt resursus sacensībās par ārstēšanu.

Miljoniem zāļu potenciālo komponentu testēšana laboratorijas apstākļos ir ļoti lēna, dārga un kļūdaina. Tā vietā zinātnieki parasti izmanto superdatorus pētniecības sākumposmā, paļaujot uz tiem, lai šķirotu šķietami bezgalīgas daudzsološu molekulu kombinācijas, ko sauc par ligandiem. Ligandu izvēle ir tie, kas spēj saistīties ar proteīnu, kas saistīts ar slimību, vai “doks”, un vai nu atceļ, vai rada signālu. Lai gan HIV terapija būtu vērsta uz vīrusu replikācijas izslēgšanu, Alzheimera ārstēšana mēģinātu aktivizēt savienojumu smadzenēs.

Bet piekļuvi šāda veida skaitļošanas jaudai var ierobežot. “Šo problēmu var atrisināt, sadalot meklēšanu mazos gabalos un nosūtot tos brīvprātīgajiem, lai strādātu,” saka Kevins Kreisers, Ph.D. Delaveras Universitātes students un projekta personāla loceklis. Tagad komanda salīdzina modeļa rezultātus no vairāk nekā 6000 pasaules brīvprātīgajiem, lai pārliecinātos, ka tie atbilst mitrā laboratorijā. Pēc simulāciju apstiprināšanas nākamais solis ir “iziet un meklēt jaunas zāles”, saka Kreiser.

Datoru dīkstāves laika ziedojumi varētu palielināt ātrumu, ar kādu potenciālās jaunās zāles nonāk laboratorijā, un ar veiksmi atrast ceļu uz pacientiem. „Mēs palīdzēsim zinātniekiem, sašaurinot potenciālo mērķa molekulu sarakstu,” saka Taufers.

Kādu dienu lietotāji, izmantojot grafisko interfeisu, var izvēlēties molekulas un novietot tos mērķa proteīnos. Šis jaunākais projekts, Kreiser saka, tiecas “izmantot lietotāju izlūkošanas datus, lai aprēķināšana notiktu ātrāk.”

Pašlaik brīvprātīgie var vienkārši atpūsties ar kafiju rokā un ļaut saviem datoriem vergu prom. Projekta pašreizējais ekrānsaudzētājs, ko arī izstrādājis Kreisers, parāda lietotāju iemaksas zinātnē ar manipulējamo molekulāro struktūru 3D attēlojumu. „Jums nav jāatrodas tur un jādarbojas stundas,” saka Kreiser. „Vienkārši ļaujiet tai darboties fonā. Bez sāpēm."

HIV proteāzes attēls, kas ir viens no projekta simulēto molekulu mērķiem, ar iStockPhoto palīdzību.

Izteiktie viedokļi ir autora (-u) viedokļi, un tie nav obligāti.